應用慢病毒shRNA文庫結合二代測序篩選白血病細胞系增殖相關lncRNA

【摘要】：長鏈非編碼RNA (lncRNA) 是包括細胞增殖在內的許多細胞過程的重要調節因子。雖然已有研究表明多種lncRNA在造血系統惡性腫瘤的發生發展過程中發揮重要作用，但是缺少一個更全面和無偏倚的方法同時研究多個lncRNA中對白血病細胞系產生功能性影響的lncRNA。在此，我們利用短發夾RNA (shRNA) 文庫結合高通量測序的方法，篩選對白血病細胞系增殖有影響的lncRNA，確定了74個候選lncRNAs。從中選取lncRNA C20orf204-203作為驗證研究對象，發現C20orf204-203在K562和THP-1細胞系中均定位于胞質，敲降C20orf204-203的K562和THP-1細胞系增殖能力降低，早期凋亡細胞增加，BAD基因在mRNA水平上表達量增加，TP53、BCL2蛋白表達量下降，在THP-1細胞系中Caspase 3蛋白表達量減少，激活型Caspase 3蛋白表達量上升，但是二者變化在兩種細胞系中不一致。結果表明，在白血病細胞系中敲降lncRNA C20orf204-203會使細胞增殖能力降低。但其在不同細胞系作用途徑和機制可能存在差異。這一研究表明了利用shRNA文庫結合高通量測序大規模研究lncRNA在白血病細胞系中發揮作用的可行性。

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中國期刊全文數據庫

前18條

1	曾薇;劉翼;李文婷;朱金峰;;結直腸癌中差異性表達的外泌體lncRNA 功能富集及通路分析[J];中華全科醫學;2022年01期
2	鄧家琦;況容;范宇;李明星;;甲狀腺癌免疫相關lncRNA生物標志物的生物信息學研究[J];現代免疫學;2022年02期
3	汪萍;胡欣;劉康;別俊;;LncRNA在食管癌中的研究進展[J];中國醫藥導報;2022年07期
4	申藝騰;王超蘭;李思;裴苒君;安旭;王建平;;結直腸癌相關的lncRNA及其作用的研究[J];甘肅醫藥;2021年02期
5	李磊;陳彥平;;lncRNA在口腔鱗癌中的研究進展[J];中外醫學研究;2021年03期
6	周俊宏;蔣萍;張清晏;何桂琴;蔚芃;;骨巨細胞瘤中lncRNA的差異表達及其臨床應用價值[J];四川醫學;2021年04期
7	杜寶順;王運剛;尚飛;張哲瑩;;膠質母細胞瘤預后預測lncRNA模型的建立及驗證[J];腫瘤基礎與臨床;2021年04期
8	劉革新;劉盼;陳維順;;胃癌免疫相關LncRNA預后風險模型的建立與分析[J];現代消化及介入診療;2021年07期
9	吳嘉誠;鄭大為;朱林文;李旎;邵國豐;;lncRNA在食管癌中的表達及應用研究進展[J];浙江醫學;2021年20期
10	智潔;李亞星;賈漪濤;;外泌體介導的lncRNA在結直腸癌發生發展過程中的作用及研究進展[J];中國腫瘤臨床;2021年20期
11	楊思琦;姚頤;宋啟斌;;非小細胞肺癌中LncRNA表達的研究現狀[J];中國醫藥導報;2019年32期
12	李星辰;王建六;趙麗君;;LncRNA在子宮內膜癌發病中的研究進展[J];中國婦產科臨床雜志;2020年02期
13	李穎;賈迪;楊丹;;信號通路相關的lncRNA與骨肉瘤關系的研究進展[J];生命的化學;2020年03期
14	趙亮;章佳躍;劉志遠;王宇;趙鵬;;基于多個lncRNA表達量的風險模型預測膠質母細胞瘤患者預后的研究[J];臨床神經外科雜志;2020年02期
15	曾繁浩;雷容;張克;李祥孟;顏汝平;;LncRNA在膀胱癌發生發展中的作用機制及其應用研究進展[J];山東醫藥;2020年16期
16	陳曉嬈;楊志雄;蘇文媚;黃小碧;喻慧;周宏蓮;;lncRNA在非小細胞肺癌中的研究[J];醫學信息;2020年12期
17	劉玲;鐘慧鈺;陸小軍;;LncRNA在胃癌中的作用及機制研究進展[J];腫瘤預防與治療;2020年07期
18	吳紫微;謝圣高;;LncRNA在結直腸癌中的調控機制[J];腫瘤防治研究;2020年10期

中國重要會議論文全文數據庫

前20條

1	余軍林;李蘭;余幼林;;基于生物信息學方法構建甲狀腺癌免疫相關lncRNA預后評估模型[A];2021年中國腫瘤標志物學術大會暨第十五屆腫瘤標志物青年科學家論壇論文集[C];2021年
2	劉曉丹;關華;周平坤;;α粒子誘發人支氣管上皮細胞癌變相關LncRNA的識別鑒定[A];第八屆海峽兩岸毒理學研討會論文集[C];2015年
3	李夏君;楊淼;劉冉;尹立紅;;淮安食管癌與癌旁組織中差異表達LncRNA的初步分析[A];中國毒理學會第六屆全國毒理學大會論文摘要[C];2013年
4	寧尚偉;;lncRNA與癌癥：生物信息學方法探索和挑戰[A];中國生物工程學會第十三屆學術年會暨2019年全國生物技術大會論文集[C];2019年
5	祝淑釵;劉志坤;楊潔;蘇景偉;王玉祥;沈文斌;李娟;;53BP1基因shRNA慢病毒表達載體構建及穩定轉染食管癌細胞株的建立及鑒定[A];中華醫學會放射腫瘤治療學分會六屆二次暨中國抗癌協會腫瘤放療專業委員會二屆二次學術會議論文集[C];2009年
6	祝淑釵;劉志坤;楊潔;蘇景偉;王玉祥;沈文斌;李娟;;53BP1基因shRNA慢病毒表達載體構建及穩定轉染食管癌細胞株的建立及鑒定[A];中國第九屆全國食管癌學術會議論文集[C];2009年
7	祝淑釵;劉志坤;楊潔;蘇景偉;王玉祥;沈文斌;李娟;;53BP1基因shRNA慢病毒表達載體構建及穩定轉染食管癌細胞株的建立及鑒定[A];第五屆全國中醫藥免疫學術研討會——暨環境·免疫與腫瘤防治綜合交叉會議論文匯編[C];2009年
8	陳吉莉;劉蓮;蔡鑫嘉;姚志剛;黃俊輝;;長鏈非編碼RNA(lncRNA）在舌鱗狀細胞癌中的研究進展[A];2019年中華口腔醫學會口腔病理學專業委員會第十三次全國口腔病理學術會議論文匯編[C];2019年
9	劉志坤;祝淑釵;蘇景偉;王玉祥;楊潔;李娟;沈文斌;;MDC1基因shRNA慢病毒載體構建及穩定轉染食管癌細胞株的建立及鑒定[A];第五屆全國中醫藥免疫學術研討會——暨環境·免疫與腫瘤防治綜合交叉會議論文匯編[C];2009年
10	黃浩;陸欣;余南才;吳文莉;劉倩;馬威;郝建軍;易艷東;;PCNA的shRNA的真核表達載體的構建及對子宮頸癌細胞的干預性研究[A];第四屆全國臨床檢驗學術會議論文匯編[C];2006年
11	羅華榮;劉昭輝;吳登龍;洪哲;趙鑫;王天如;;膀胱尿路上皮癌與正常尿路上皮組織LncRNA表達譜差異性的研究[A];中國中西醫結合學會泌尿外科專業委員會第十四次全國學術會議暨2016年廣東省中西醫結合學會泌尿外科專業委員會學術年會論文集[C];2016年
12	李恭會;周酉楓;成晟;陳昭典;;shRNA阻抑前列腺癌細胞雄激素受體基因表達及其影響的研究[A];2005年浙江省男科學學術會議論文匯編[C];2005年
13	李增軍;邱錄貴;王國蓉;麥玉潔;李新;于珍;李長虹;徐燕;王亞非;;β-catenin特異的shRNA干擾對K562細胞生長的初步研究[A];第11次中國實驗血液學會議論文匯編[C];2007年
14	黃楨;黃利鳴;王艷林;;LncRNA與miRNA的相互關系在宮頸癌中的研究進展[A];中國生物化學與分子生物學會第十二屆全國會員代表大會暨2018年全國學術會議摘要集[C];2018年
15	何心;焦保華;梁朝輝;田偉;;shRNA靶向干擾Notch2對膠質瘤生長的體外和體內研究[A];2011中華醫學會神經外科學學術會議論文匯編[C];2011年
16	任靜文;張思怡;艾軍;單保恩;;shRNA干擾OCT4表達后對乳腺癌細胞遷移和侵襲的影響[A];第九屆全國免疫學學術大會論文集[C];2014年
17	張彩;郭切;蘭培祥;張建;田志剛;;靶向Pim-3的雙功能shRNA表達載體的構建及其對小鼠肝癌的治療作用[A];第八屆全國免疫學學術大會論文集[C];2012年
18	張璐;胡豫;孫春艷;王雅丹;褚章波;;慢病毒shRNA干擾骨髓瘤細胞BDNF表達在骨髓微環境中對血管新生的影響[A];第12屆全國實驗血液學會議論文摘要[C];2009年
19	杜利清;孟愛民;王曉春;王月英;吳紅英;張恒;李德冠;路璐;樊飛躍;;shRNA抑制Rad51蛋白表達對骨肉瘤細胞藥物敏感性和細胞周期的影響[A];中國藥理學會第十次全國學術會議?？痆C];2009年
20	曾永秋;趙矯;劉嵐;余紅;陳紹坤;稅青林;;Survivin啟動子調控的hTERT基因shRNA表達載體的構建及對腫瘤特異性靶向作用研究[A];中國的遺傳學研究——遺傳學進步推動中國西部經濟與社會發展——2011年中國遺傳學會大會論文摘要匯編[C];2011年

中國博士學位論文全文數據庫

前20條

1	唐虹;子宮內膜癌5-LncRNA預后模型的建立與調控機制研究[D];廣州中醫藥大學;2020年
2	羅育其;LncRNA在CRC組織中的表達特征和GAPLINC在CRC發生發展中的作用機制[D];南方醫科大學;2018年
3	楊梅柳;LncRNA在甲狀腺乳頭狀癌中的表達及功能分析[D];河北醫科大學;2016年
4	于航;窄帶成像聯合放大內鏡對早期胃癌篩查的診斷價值和早期胃癌LncRNA表達譜分析及其生物學功能探索[D];北京協和醫學院;2016年
5	鐘赟;基于芯片數據進行生物信息學分析以構建多發性骨髓瘤lncRNA相關的預后風險模型及驗證[D];南昌大學;2021年
6	葛明華;甲狀腺乳頭狀癌轉移相關lncRNA的篩選及lncRNA AP000472.2促進其轉移作用機制研究[D];浙江大學;2018年
7	王富博;尿液lncRNA在前列腺癌早期診斷以及新型miRNA在進展機制中的研究[D];第二軍醫大學;2016年
8	閆廣鑫;肝癌TACE前后lncRNA表達譜變化及lncRNA AC018682.1在肝癌進展的機制研究[D];中國醫科大學;2021年
9	苑春雨;瘢痕疙瘩中lncRNA表達譜及基因組甲基化異常的初探[D];北京協和醫學院;2017年
10	常巍;8q24區域的LncRNA基因多態性與廣東順德人群原發性肝癌的遺傳關聯性研究[D];南方醫科大學;2016年
11	王劭博;LncRNA低氧調控及拷貝數變異促進膠質瘤惡性進展的機制研究[D];山東大學;2021年
12	雷俊琴;立體定向放射技術治療結直腸癌肝與肺寡轉移的Ⅱ期研究與直腸癌新輔助同步放化療后病理緩解相關的lncRNA及mRNA研究[D];北京協和醫學院;2020年
13	何雯婷;lncRNA＿LINC00200在胃癌進展中的作用及機制研究[D];蘇州大學;2019年
14	張穎一;胃癌中差異表達mRNA、lncRNA、circRNA的鑒定分析及核心circRNA circFOXO3的功能與作用[D];中國人民解放軍海軍軍醫大學;2020年
15	雷建華;應用ShRNA研究HBX基因表達和三氧化二砷對HepG2細胞凋亡特性的影響[D];中南大學;2006年
16	張國超;食管鱗癌不同新輔助治療模式對比及lncRNA分子模型在新輔助放化療療效預測中的價值研究[D];北京協和醫學院;2021年
17	陳濤;膀胱癌中差異表達的lncRNA篩選及功能分析[D];天津醫科大學;2016年
18	貢冰峰;靶向PCNA基因的siRNA和shRNA抑制膀胱癌生長的體內外實驗研究[D];蘇州大學;2009年
19	汪步海;shRNA介導的COX-2表達抑制對人胃癌細胞系SGC-7901增殖和凋亡影響的研究[D];華中科技大學;2006年
20	孫建濤;PSMA增強子/啟動子驅動shRNA靶向干擾核干因子治療前列腺癌的研究[D];天津醫科大學;2008年

中國碩士學位論文全文數據庫

前20條

1	田磊;識別乳腺癌中lncRNA相關調控網絡的算法研究[D];湖南大學;2020年
2	劉玉鳳;肺癌放療抵抗相關長鏈非編碼RNA（LncRNA）表達譜初步篩選及功能研究[D];蘇州大學;2018年
3	張珈源;胃癌長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達譜及其相關ceRNA分子調控網絡的分析[D];吉林大學;2018年
4	殷喜豐;腫瘤胞外酸性微環境對腎癌769-P細胞株體外侵襲能力及其LncRNA表達譜的影響[D];江蘇大學;2018年
5	趙麗春;三種lncRNA與卵巢癌紫杉醇耐藥相關分析[D];新鄉醫學院;2018年
6	林培藝;肝內膽管細胞癌差異LncRNA表達分析[D];上海交通大學;2015年
7	王一凡;基于lncRNA表達譜的膀胱癌預后列線圖的建立及預后lncRNA的功能研究[D];山東大學;2020年
8	李凌雪;lncRNA參與幽門螺桿菌感染相關胃癌的功能及機制研究[D];北京協和醫學院;2016年
9	鐘慶雯;頭頸部鱗狀細胞癌與自噬相關lncRNA生物信息學分析[D];南方醫科大學;2021年
10	楊雪梅;基于lncRNA表達譜的乳腺癌綜合預后預測模型的建立[D];山東大學;2020年
11	巨承;LncRNA在骨肉瘤中的表達及作用機制研究[D];南昌大學;2020年
12	許家瑞;乳腺癌差異miRNA和相關lncRNA篩選、驗證及其功能研究[D];廣州中醫藥大學;2019年
13	張天祺;慢性非萎縮性胃炎-胃癌前病變-胃癌組織中lncRNA表達的差異分析[D];青島大學;2021年
14	顧小波;食管鱗狀細胞癌中lncRNA的表達及意義[D];西南醫科大學;2016年
15	曾麗萍;基于mRNA和lncRNA轉錄組水平構建膽管癌的預后預測模型[D];南昌大學;2021年
16	王少輝;基于肺鱗癌自噬相關lncRNA預后風險模型的建立[D];中國醫科大學;2021年
17	許珍汝;慢性粒細胞白血病多藥耐藥細胞lncRNA轉錄組學分析及其功能研究[D];南華大學;2020年
18	黃麗涵;胰腺導管腺癌血漿中外泌體lncRNA表達譜研究[D];福建醫科大學;2021年
19	舒立榮;乳腺癌血漿外泌體中lncRNA的篩查及候選分子標記物的生物信息學分析[D];深圳大學;2020年
20	段偉麗;膀胱癌血清lncRNA診斷模型的建立及其對膀胱癌復發監測的臨床意義[D];山東大學;2017年

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